Bajo el brazo sur del transepto hay una pequeña cripta en la que se hallan los restos de santo Domingo en su sarcófago. Justo enfrente del gallinero en que una pareja de gallo y gallina blancos inundan con sus cantos la catedral. En esta zona se repusieron las imágenes que representan a los apóstoles Pedro y Juan, además de la del santo titular con el peregrino liberado que le ofrece sus cadenas en agradecimiento. Las dos primeras esculturas junto con otras dos del mismo formato que se guardan en el museo situado en el clausto mudejar (Imagen 8) deben de proceder de una portada monumental desaparecida.
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Tallas de San Pedro y San Juan, recolocadas en la cripta del Santo. Bajo estas líneas, estatua de Santo Domingo y detalle de su cara.
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Las tallas de estos apóstoles guardan una sorprendente similitud de hechuras con las que sustentan la mesa del altar en la colegiata de Santillana del Mar en Cantabria.